Horvath, P. ; Coscia, F.*
Mol. Syst. Biol. 21, 526 - 530 (2025)
Pietzner, M.* ; Beuchel, C.* ; Demircan, K.* ; Hoffmann Anton, J.* ; Zeng, W.* ; Römisch-Margl, W. ; Yasmeen, S.* ; Uluvar, B.* ; Zoodsma, M.* ; Koprulu, M.* ; Kastenmüller, G. ; Carrasco-Zanini, J.* ; Langenberg, C.*
Mol. Syst. Biol., DOI: 10.1038/s44320-025-00158-6 (2025)
Stock, M. ; Losert, C. ; Zambon, M. ; Popp, N. ; Lubatti, G. ; Hörmanseder, E. ; Heinig, M. ; Scialdone, A.
Mol. Syst. Biol. 21, 214-230 (2025)
Lobentanzer, S.* ; Rodriguez-Mier, P.* ; Bauer, S. ; Saez-Rodriguez, J.*
Mol. Syst. Biol., DOI: 10.1038/s44320-024-00041-w (2024)
Mitic, N.* ; Neuschulz, A.* ; Spanjaard, B.* ; Schneider, J. ; Fresmann, N.* ; Novoselc, K.T. ; Strunk, T.* ; Münster, L.* ; Olivares-Chauvet, P.* ; Ninkovic, J. ; Junker, J.P.*
Mol. Syst. Biol. 20, 321-337 (2024)
Tomaz da Silva, P.* ; Zhang, Y.* ; Theodorakis, E.* ; Martens, L.D. ; Yépez, V.A.* ; Pelechano, V.* ; Gagneur, J.
Mol. Syst. Biol. 20, 506-520 (2024)
Lotfollahi, M. ; Klimovskaia Susmelj, A.* ; De Donno, C. ; Hetzel, L. ; Ji, Y. ; Ibarra Del Rio, I.A. ; Srivatsan, S.R.* ; Naghipourfar, M.* ; Daza, R.M.* ; Martin, B.* ; Shendure, J.* ; McFaline-Figueroa, J.L.* ; Boyeau, P.* ; Wolf, F.A. ; Yakubova, N.* ; Günnemann, S.* ; Trapnell, C.* ; Lopez-Paz, D.* ; Theis, F.J.
Mol. Syst. Biol. 19:e11517 (2023)
Polychronidou, M.* ; Hou, J.* ; Babu, M.M.* ; Liberali, P.* ; Amit, I.* ; Deplancke, B.* ; Lahav, G.* ; Itzkovitz, S.* ; Mann, M.* ; Saez-Rodriguez, J.* ; Theis, F.J. ; Eils, R.*
Mol. Syst. Biol. 19:e11799 (2023)
Thielert, M.* ; Itang, E.C.* ; Ammar, C.* ; Rosenberger, F.A.* ; Bludau, I.* ; Schweizer, L.* ; Nordmann, T.M.* ; Skowronek, P.* ; Wahle, M.* ; Zeng, W.F.* ; Zhou, X.X.* ; Brunner, A.D.* ; Richter, S. ; Levesque, M.P.* ; Theis, F.J. ; Steger, M.* ; Mann, M.*
Mol. Syst. Biol. 19:e11503 (2023)
Urban, L. ; Perlas Puente,A. ; Francino, O.* ; Martí-Carreras, J.* ; Muga, B.A.* ; Mwangi, J.W.* ; Boykin Okalebo, L.* ; Stanton, J.A.L.* ; Black, A.* ; Waipara, N.* ; Fontsere, C.* ; Eccles, D.* ; Urel, H. ; Reska, T.T.M. ; Morales, H.E.* ; Palmada-Flores, M.* ; Marques-Bonet, T.* ; Watsa, M.* ; Libke, Z.* ; Erkenswick, G.* ; van Oosterhout, C.*
Mol. Syst. Biol. 19:e11686 (2023)
Brunner, A.D.* ; Thielert, M.* ; Vasilopoulou, C.G.* ; Ammar, C.* ; Coscia, F.* ; Mund, A.* ; Hoerning, O.B.* ; Bache, N.* ; Apalategui, A.* ; Lubeck, M.* ; Richter, S. ; Fischer, D.S. ; Raether, O.* ; Park, M.A.* ; Meier, F.* ; Theis, F.J. ; Mann, M.*
Mol. Syst. Biol. 18:e10798 (2022)
Hersbach, B.A. ; Fischer, D.S. ; Masserdotti, G. ; Deeksha ; Mojžišová, K. ; Waltzhöni, T. ; Rodriguez-Terro, D. ; Heinig, M. ; Theis, F.J. ; Götz, M. ; Stricker, S.H.
Mol. Syst. Biol. 18:e11129 (2022)
Ibarra Del Rio, I.A. ; Ratnu, V.S.* ; Gordillo, L.* ; Hwang, I.Y.* ; Mariani, L.* ; Weinand, K.* ; Hammarén, H.M.* ; Heck, J.* ; Bulyk, M.L.* ; Savitski, M.M.* ; Zaugg, J.B.* ; Noh, K.M.*
Mol. Syst. Biol. 18:e10473 (2022)
Bergen, V. ; Soldatov, R.A.* ; Kharchenko, P.V.* ; Theis, F.J.
Mol. Syst. Biol. 17:e10282 (2021)
Molbay, M. ; Kolabas, Z.I. ; Todorov, M.I. ; Ohn, T.-L. ; Ertürk, A.
Mol. Syst. Biol. 17:e9807 (2021)
Ostaszewski, M.* ; Niarakis, A.* ; Mazein, A.* ; Kuperstein, I.* ; Phair, R.* ; Orta-Resendiz, A.* ; Singh, V.* ; Aghamiri, S.S.* ; Acencio, M.L.* ; Glaab, E.* ; Ruepp, A. ; Fobo, G. ; Montrone, C. ; Brauner, B. ; Frishman, G. ; Monraz Gómez, L.C.* ; Somers, J.* ; Hoch, M.* ; Kumar Gupta, S.* ; Scheel, J.* ; Borlinghaus, H.* ; Czauderna, T.* ; Schreiber, F.* ; Montagud, A.* ; Ponce de Leon, M.* ; Funahashi, A.* ; Hiki, Y.* ; Hiroi, N.* ; Yamada, T.G.* ; Dräger, A.* ; Renz, A.* ; Naveez, M.* ; Bocskei, Z.* ; Messina, F.* ; Börnigen, D.* ; Fergusson, L.* ; Conti, M.* ; Rameil, M.* ; Nakonecnij, V.* ; Vanhoefer, J.* ; Schmiester, L.* ; Wang, M.* ; Ackerman, E.E.* ; Shoemaker, J.E.* ; Zucker, J.* ; Oxford, K.* ; Teuton, J.* ; Kocakaya, E.* ; Summak, G.Y.* ; Hanspers, K.* ; Kutmon, M.* ; Coort, S.* ; Eijssen, L.* ; Ehrhart, F.* ; Rex, D.A.B.* ; Slenter, D.* ; Martens, M.* ; Pham, N.* ; Haw, R.* ; Jassal, B.* ; Matthews, L.* ; Orlic-Milacic, M.* ; Senff Ribeiro, A.* ; Rothfels, K.* ; Shamovsky, V.* ; Stephan, R.* ; Sevilla, C.* ; Varusai, T.* ; Ravel, J.M.* ; Fraser, R.* ; Ortseifen, V.* ; Marchesi, S.* ; Gawron, P.* ; Smula, E.* ; Heirendt, L.* ; Satagopam, V.P.* ; Wu, G.* ; Riutta, A.* ; Golebiewski, M.* ; Owen, S.* ; Goble, C.* ; Hu, X.* ; Overall, R.W.* ; Maier, D.* ; Bauch, A.* ; Gyori, B.M.* ; Bachman, J.A.* ; Vega, C.* ; Grouès, V.* ; Vázquez, M.J.* ; Porras, P.* ; Licata, L.* ; Iannuccelli, M.* ; Sacco, F.* ; Nesterova, A.* ; Yuryev, A.* ; de Waard, A.* ; Turei, D.* ; Luna, A.* ; Babur, O.* ; Soliman, S.* ; Valdeolivas, A.* ; Esteban-Medina, M.* ; Peña-Chilet, M.* ; Rian, K.* ; Helikar, T.* ; Lal Puniya, B.* ; Módos, D.* ; Treveil, A.* ; Olbei, M.* ; De Meulder, B.* ; Ballereau, S.* ; Dugourd, A.* ; Naldi, A.* ; Noël, V.* ; Calzone, L.* ; Sander, C.* ; Demir, E.* ; Korcsmáros, T.* ; Freeman, T.C.* ; Augé, F.* ; Beckmann, J.S.* ; Hasenauer, J. ; Wolkenhauer, O.* ; Wilighagen, E.L.* ; Pico, A.R.* ; Evelo, C.T.* ; Gillespie, M.E.* ; Stein, L.D.* ; Hermjakob, H.* ; D'Eustachio, P.* ; Saez-Rodriguez, J.* ; Dopazo, J.* ; Valencia, A.* ; Kitano, H.* ; Barillot, E.* ; Auffray, C.* ; Balling, R.* ; Schneider, R.*
Mol. Syst. Biol. 17:e10387 (2021)
Ostaszewski, M.* ; Niarakis, A.* ; Mazein, A.* ; Kuperstein, I.* ; Phair, R.* ; Orta-Resendiz, A.* ; Singh, V.* ; Aghamiri, S.S.* ; Acencio, M.L.* ; Glaab, E.* ; Ruepp, A. ; Fobo, G. ; Montrone, C. ; Brauner, B. ; Frishman, G. ; Monraz Gómez, L.C.* ; Somers, J.* ; Hoch, M.* ; Kumar Gupta, S.* ; Scheel, J.* ; Borlinghaus, H.* ; Czauderna, T.* ; Schreiber, F.* ; Montagud, A.* ; Ponce de Leon, M.* ; Funahashi, A.* ; Hiki, Y.* ; Hiroi, N.* ; Yamada, T.G.* ; Dräger, A.* ; Renz, A.* ; Naveez, M.* ; Bocskei, Z.* ; Messina, F.* ; Börnigen, D.* ; Fergusson, L.* ; Conti, M.* ; Rameil, M.* ; Nakonecnij, V.* ; Vanhoefer, J.* ; Schmiester, L. ; Wang, M.* ; Ackerman, E.E.* ; Shoemaker, J.E.* ; Zucker, J.* ; Oxford, K.* ; Teuton, J.* ; Kocakaya, E.* ; Summak, G.Y.* ; Hanspers, K.* ; Kutmon, M.* ; Coort, S.* ; Eijssen, L.* ; Ehrhart, F.* ; Rex, D.A.B.* ; Slenter, D.* ; Martens, M.* ; Pham, N.* ; Haw, R.* ; Jassal, B.* ; Matthews, L.* ; Orlic-Milacic, M.* ; Senff-Ribeiro, A.* ; Rothfels, K.* ; Shamovsky, V.* ; Stephan, R.* ; Sevilla, C.* ; Varusai, T.* ; Ravel, J.* ; Fraser, R.* ; Ortseifen, V.* ; Marchesi, S.* ; Gawron, P.* ; Smula, E.* ; Heirendt, L.* ; Satagopam, V.* ; Wu, G.* ; Riutta, A.* ; Golebiewski, M.* ; Owen, S.* ; Goble, C.* ; Hu, X.* ; Overall, R.W.* ; Maier, D.* ; Bauch, A.* ; Gyori, B.M.* ; Bachman, J.A.* ; Vega, C.* ; Grouès, V.* ; Vázquez, M.J.* ; Porras, P.* ; Licata, L.* ; Iannuccelli, M.* ; Sacco, F.* ; Nesterova, A.* ; Yuryev, A.* ; de Waard, A.* ; Türei, D.* ; Luna, A.* ; Babur, O.* ; Soliman, S.* ; Valdeolivas, A.* ; Esteban-Medina, M.* ; Peña-Chilet, M.* ; Rian, K.* ; Helikar, T.* ; Puniya, B.L.* ; Módos, D.* ; Treveil, A.* ; Ölbei, M.* ; De Meulder, B.* ; Ballereau, S.* ; Dugourd, A.* ; Naldi, A.* ; Noël, V.* ; Calzone, L.* ; Sander, C.* ; Demir, E.* ; Korcsmáros, T.* ; Freeman, T.C.* ; Augé, F.* ; Beckmann, J.S.* ; Hasenauer, J. ; Wolkenhauer, O.* ; Willighagen, E.L.* ; Pico, A.R.* ; Evelo, C.T.* ; Gillespie, M.E.* ; Stein, L.D.* ; Hermjakob, H.* ; D'Eustachio, P.* ; Saez-Rodriguez, J.* ; Dopazo, J.* ; Valencia, A.* ; Kitano, H.* ; Barillot, E.* ; Auffray, C.* ; Balling, R.* ; Schneider, R.*
Mol. Syst. Biol. 17:e10851 (2021)
Türei, D.* ; Valdeolivas, A.* ; Gul, L.* ; Palacio-Escat, N.* ; Klein, M. ; Ivanova, O.* ; Ölbei, M.* ; Gábor, A.* ; Theis, F.J. ; Módos, D.* ; Korcsmáros, T.* ; Saez-Rodriguez, J.*
Mol. Syst. Biol. 17:e9923 (2021)
Fischer, D.S. ; Wu, Y. ; Schubert, B. ; Theis, F.J.
Mol. Syst. Biol. 16:e9416 (2020)
Eraslan, B.* ; Wang, D.* ; Gusic, M. ; Prokisch, H. ; Hallström, B.M.* ; Uhlén, M.* ; Asplund, A.* ; Pontén, F.* ; Wieland, T.* ; Hopf, T.* ; Hahne, H.* ; Kuster, B.* ; Gagneur, J.*
Mol. Syst. Biol. 15:e8513 (2019)
Luecken, M. ; Theis, F.J.
Mol. Syst. Biol. 15:e8746 (2019)
Niu, L.* ; Geyer, P.E.* ; Wewer Albrechtsen, N.J.* ; Gluud, L.L.* ; Santos, A.* ; Doll, S.* ; Treit, P.V.* ; Holst, J.J.* ; Knop, F.K.* ; Vilsbøll, T.* ; Junker, A.* ; Sachs, S. ; Stemmer, K. ; Müller, T.D. ; Tschöp, M.H. ; Hofmann, S.M. ; Mann, M.*
Mol. Syst. Biol. 15:e8793 (2019)
Argelaguet, R.* ; Velten, B.* ; Arnol, D.* ; Dietrich, S.* ; Zenz, T.* ; Marioni, J.C.* ; Buettner, F. ; Huber, W.* ; Stegle, O.*
Mol. Syst. Biol. 14:e8124 (2018)
Griffiths, J.A.* ; Scialdone, A. ; Marioni, J.C.*
Mol. Syst. Biol. 14:e8046 (2018)
Schiller, H. B.* ; Fernandez, I.E. ; Burgstaller, G. ; Schaab, C.* ; Scheltema, R.A.* ; Schwarzmayr, T. ; Strom, T.M. ; Eickelberg, O. ; Mann, M.*
Mol. Syst. Biol. 11:819 (2015)
Iskar, M.* ; Zeller, G.* ; Blattmann, P.* ; Campillos, M. ; Kuhn, M.* ; Kaminska, K.H.* ; Runz, H.* ; Gavin, A.C.* ; Pepperkok, R.* ; van Noort, V.* ; Bork, P.*
Mol. Syst. Biol. 9:662 (2013)
Kuhn, M.* ; Al Banchaabouchi, M.* ; Campillos, M. ; Jensen, L.J.* ; Gross, C.* ; Gavin, A.C.* ; Bork, P.*
Mol. Syst. Biol. 9:663 (2013)
Wang-Sattler, R. ; Yu, Z. ; Herder, C.* ; Messias, A.C. ; Floegel, A.* ; He, Y.* ; Heim, K. ; Campillos, M.J. ; Holzapfel, C. ; Thorand, B. ; Grallert, H. ; Xu, T. ; Bader, E. ; Huth, C. ; Mittelstraß, K. ; Döring, A. ; Meisinger, C. ; Gieger, C. ; Prehn, C. ; Römisch-Margl, W. ; Carstensen, M.* ; Xie, L.* ; Yamanaka-Okumura, H.* ; Xing, G.* ; Ceglarek, U.* ; Thiery, J.* ; Giani, G.* ; Lickert, H. ; Lin, X.* ; Li, Y.* ; Boeing, H.* ; Joost, H.-G.* ; Hrabě de Angelis, M. ; Rathmann, W.* ; Suhre, K. ; Prokisch, H. ; Peters, A. ; Meitinger, T. ; Roden, M.* ; Wichmann, H.-E. ; Pischon, T.* ; Adamski, J. ; Illig, T.
Mol. Syst. Biol. 8:615 (2012)
Kiel, C.* ; Vogt, A. ; Campagna, A.* ; Chatr-aryamontri, A.* ; Swiatek-de Lange, M. ; Beer, M. ; Bolz, S.* ; Mack, A.F.* ; Kinkl, N.* ; Cesareni, G.* ; Serrano, L.* ; Ueffing, M.
Mol. Syst. Biol. 7:551 (2011)