Yu, Z.* ; Zhao, B.* ; Zhang, S.* ; Chen, X.* ; Yan, F.* ; Feng, J.* ; Peng, T. ; Zhang, X.Y.*
HiFi-Syn: Hierarchical granularity discrimination for high-fidelity synthesis of MR images with structure preservation.
Med. Image Anal. 100:103390 (2024)
Wright, R.* ; Gomez, A.* ; Zimmer, V.A.* ; Toussaint, N.* ; Khanal, B.* ; Matthew, J.* ; Skelton, E.* ; Kainz, B.* ; Rueckert, D.* ; Hajnal, J.V.* ; Schnabel, J.A.
Fast fetal head compounding from multi-view 3D ultrasound.
Med. Image Anal. 89:102793 (2023)
Ayhan, M.S.* ; Kuemmerle, L. ; Kühlewein, L.* ; Inhoffen, W.* ; Aliyeva, G.* ; Ziemssen, F.* ; Berens, P.*
Clinical validation of saliency maps for understanding deep neural networks in ophthalmology.
Med. Image Anal. 77:102364 (2022)
Bilic, P.* ; Christ, P.* ; Li, H.B.* ; Vorontsov, E.A.* ; Ben-Cohen, A.* ; Kaissis, G.* ; Szeskin, A.* ; Jacobs, C.* ; Mamani, G.E.H.* ; Chartrand, G.* ; Lohöfer, F.* ; Holch, J.W.* ; Sommer, W.* ; Hofmann, F.* ; Hostettler, A.* ; Lev-Cohain, N.* ; Drozdzal, M.* ; Amitai, M.M.* ; Vivanti, R.* ; Sosna, J.* ; Ezhov, I.* ; Sekuboyina, A.* ; Navarro, F.* ; Kofler, F. ; Paetzold, J.C. ; Shit, S.* ; Hu, X.* ; Lipkova, J.* ; Rempfler, M.* ; Piraud, M. ; Kirschke, J.* ; Wiestler, B.* ; Zhang, Z.* ; Hülsemeyer, C.* ; Beetz, M.* ; Ettlinger, F.* ; Antonelli, M.* ; Bae, W.* ; Bellver, M.* ; Bi, L.* ; Chen, H.* ; Chlebus, G.* ; Dam, E.B.* ; Dou, Q.* ; Fu, C.W.* ; Georgescu, B.* ; Giró-I-Nieto, X.* ; Gruen, F.* ; Han, X.* ; Heng, P.A.* ; Hesser, J.* ; Moltz, J.H.* ; Igel, C.* ; Isensee, F.* ; Jäger, P.* ; Jia, F.* ; Kaluva, K.C.* ; Khened, M.* ; Kim, I.* ; Kim, J.H.* ; Kim, S.* ; Kohl, S.* ; Konopczynski, T.* ; Kori, A.* ; Krishnamurthi, G.* ; Li, F.* ; Li, H.* ; Li, J.* ; Li, X.* ; Lowengrub, J.* ; Ma, J.* ; Maier-Hein, K.* ; Maninis, K.K.* ; Meine, H.* ; Merhof, D.* ; Pai, A.* ; Perslev, M.* ; Petersen, J.* ; Pont-Tuset, J.* ; Qi, J.* ; Qi, X.* ; Rippel, O.* ; Roth, K.* ; Sarasua, I.* ; Schenk, A.* ; Shen, Z.* ; Torres, J.* ; Wachinger, C.* ; Wang, C.* ; Weninger, L.* ; Wu, J.* ; Xu, D.* ; Yang, X.* ; Yu, S.C.H.* ; Yuan, Y.* ; Yue, M.* ; Zhang, L.* ; Cardoso, J.* ; Bakas, S.* ; Braren, R.* ; Heinemann, V.* ; Pal, C.* ; Tang, A.* ; Kadoury, S.* ; Soler, L.* ; Van Ginneken, B.* ; Greenspan, H.* ; Joskowicz, L.* ; Menze, B.*
The Liver Tumor Segmentation Benchmark (LiTS).
Med. Image Anal. 84:102680 (2022)
Li, L.* ; Zimmer, V.A.* ; Schnabel, J.A. ; Zhuang, X.*
AtrialJSQnet: A New framework for joint segmentation and quantification of left atrium and scars incorporating spatial and shape information.
Med. Image Anal. 76:102303 (2022)
Li, L.* ; Zimmer, V.A.* ; Schnabel, J.A. ; Zhuang, X.*
Medical image analysis on left atrial LGE MRI for atrial fibrillation studies: A review.
Med. Image Anal. 77:102360 (2022)
Upschulte, E.* ; Harmeling, S.* ; Amunts, K.* ; Dickscheid, T.*
Contour proposal networks for biomedical instance segmentation.
Med. Image Anal. 77:102371 (2022)
Zimmer, V.A.* ; Gomez, A.* ; Skelton, E.* ; Wright, R.* ; Wheeler, G.* ; Deng, S.* ; Ghavami, N.* ; Lloyd, K.* ; Matthew, J.* ; Kainz, B.* ; Rueckert, D.* ; Hajnal, J.V.* ; Schnabel, J.A.
Placenta segmentation in ultrasound imaging: Addressing sources of uncertainty and limited field-of-view.
Med. Image Anal. 83:102639 (2022)
Baur, C.* ; Denner, S.* ; Wiestler, B.* ; Navab, N.* ; Albarqouni, S.
Autoencoders for unsupervised anomaly segmentation in brain MR images: A comparative study.
Med. Image Anal. 69:101952 (2021)
Sekuboyina, A.* ; Husseini, M.E.* ; Bayat, A.* ; Löffler, M.* ; Liebl, H.* ; Li, H.* ; Tetteh, G.* ; Kukacka, J. ; Payer, C.* ; Štern, D.* ; Urschler, M.* ; Chen, M.* ; Cheng, D.S.* ; Lessmann, N.* ; Hu, Y.* ; Wang, T.* ; Yang, D.* ; Xu, D.* ; Ambellan, F.* ; Amiranashvili, T.* ; Ehlke, M.* ; Lamecker, H.* ; Lehnert, S.* ; Lirio, M.* ; Olaguer, N.P.d.* ; Ramm, H.* ; Sahu, M.* ; Tack, A.* ; Zachow, S.* ; Jiang, T.* ; Ma, X.* ; Angerman, C.* ; Wang, X.* ; Brown, K.* ; Kirszenberg, A.* ; Puybareau, É.* ; Chen, D.* ; Bai, Y.* ; Rapazzo, B.H.* ; Yeah, T.* ; Zhang, A.* ; Xu, S.* ; Hou, F.* ; He, Z.* ; Zeng, C.* ; Xiangshang, Z.* ; Liming, X.* ; Netherton, T.J.* ; Mumme, R.P.* ; Court, L.E.* ; Huang, Z.* ; He, C.* ; Wang, L.W.* ; Ling, S.H.* ; Huỳnh, L.D.* ; Boutry, N.* ; Jakubicek, R.* ; Chmelik, J.* ; Mulay, S.* ; Sivaprakasam, M.* ; Paetzold, J.C.* ; Shit, S.* ; Ezhov, I.* ; Wiestler, B.* ; Glocker, B.* ; Valentinitsch, A.* ; Rempfler, M.* ; Menze, B.H.* ; Kirschke, J.S.*
VERSE: A Vertebrae labelling and segmentation benchmark for multi-detector CT images.
Med. Image Anal. 73:102166 (2021)
Öksüz, I.* ; Ruijsink, B.* ; Puyol-Antón, E.* ; Clough, J.R.* ; Cruz, G.* ; Bustin, A.* ; Prieto, C.* ; Botnar, R.M.* ; Rueckert, D.* ; Schnabel, J.A.* ; King, A.P.*
Automatic CNN-based detection of cardiac MR motion artefacts using k-space data augmentation and curriculum learning.
Med. Image Anal. 55, 136-147 (2019)
Schnabel, J.A.* ; Davatzikos, C.* ; Fichtinger, G.* ; Frangi, A.F.* ; Alberola-López, C.*
Special issue on MICCAI 2018.
Med. Image Anal. 58:101560 (2019)
Brady, S.M.* ; Highnam, R.* ; Irving, B.* ; Schnabel, J.A.*
Oncological image analysis.
Med. Image Anal. 33, 7-12 (2016)
Heinrich, M.P.* ; Simpson, I.J.A.* ; Papiez, B.W.* ; Brady, S.M.* ; Schnabel, J.A.*
Deformable image registration by combining uncertainty estimates from supervoxel belief propagation.
Med. Image Anal. 27, 57-71 (2016)
Irving, B.* ; Franklin, J.M.* ; Papiez, B.W.* ; Anderson, E.M.* ; Sharma, R.A.* ; Gleeson, F.V.* ; Brady, S.M.* ; Schnabel, J.A.*
Pieces-of-parts for supervoxel segmentation with global context: Application to DCE-MRI tumour delineation.
Med. Image Anal. 32, 69-83 (2016)
Peter, L.* ; Mateus, D. ; Chatelain, P.* ; Declara, D.* ; Schworm, N.* ; Stangl, S.* ; Multhoff, G. ; Navab, N.*
Assisting the examination of large histopathological slides with adaptive forests.
Med. Image Anal. 35, 655-668 (2016)
Pontabry, J. ; Rousseau, F.* ; Studholme, C.* ; Koob, M.* ; Dietemann, J.L.*
A discriminative feature selection approach for shape analysis: Application to fetal brain cortical folding.
Med. Image Anal. 35, 313-326 (2016)
Schnabel, J.A.* ; Heinrich, M.P.* ; Papiez, B.W.* ; Brady, J.M.*
Advances and challenges in deformable image registration: From image fusion to complex motion modelling.
Med. Image Anal. 33, 145-148 (2016)
Isgum, I.* ; Benders, M.J.N.L.* ; Avants, B.* ; Cardoso, M.J.* ; Counsell, S.J.* ; Gomez, E.F.* ; Gui, L.* ; Huppi, P.S.* ; Kersbergen, K.J.* ; Makropoulos, A.* ; Melbourne, A.* ; Moeskops, P.* ; Mol, C.P.* ; Kuklisova-Murgasova, M.* ; Rueckert, D.* ; Schnabel, J.A.* ; Srhoj-Egekher, V.* ; Wu, J.* ; Wang, S.* ; de Vries, L.S.* ; Viergever, M.A.*
Evaluation of automatic neonatal brain segmentation algorithms: The NeoBrainS12 challenge.
Med. Image Anal. 20, 135-151 (2015)
Simpson, I.J.A.* ; Cardoso, M.J.* ; Modat, M.* ; Cash, D.M.* ; Woolrich, M.W.* ; Andersson, J.L.R.* ; Schnabel, J.A.* ; Ourselin, S.*
Probabilistic non-linear registration with spatially adaptive regularisation.
Med. Image Anal. 26, 203-216 (2015)
Papiez, B.W.* ; Heinrich, M.P.* ; Fehrenbach, J.* ; Risser, L.* ; Schnabel, J.A.*
An implicit sliding-motion preserving regularisation via bilateral filtering for deformable image registration.
Med. Image Anal. 18, 1299-1311 (2014)
Eslami, A. ; Karamalis, A.* ; Katouzian, A.* ; Navab, N.*
Segmentation by retrieval with guided random walks: Application to left ventricle segmentation in MRI.
Med. Image Anal. 17, 236-253 (2013)
Kirişli, H.A.* ; Schaap, M.* ; Metz, C.T.* ; Dharampal, A.S.* ; Meijboom, W.B.* ; Papadopoulou, S.L.* ; Dedic, A.* ; Nieman, K.* ; de Graaf, M.A.* ; Meijs, M.F.L.* ; Cramer, M.J.* ; Broersen, A.* ; Cetin, S.* ; Eslami, A. ; Flórez-Valencia, L.* ; Lor, K.L.* ; Matuszewski, B.* ; Melki, I.* ; Mohr, B.* ; Öksüz, I.* ; Shahzad, R.* ; Wang, C.* ; Kitslaar, P.H.* ; Unal, G.* ; Katouzian, A.* ; Orkisz, M.* ; Chen, C.M.* ; Precioso, F.* ; Najman, L.* ; Masood, S.* ; Ünay, D.* ; van Vliet, L.* ; Moreno, R.* ; Goldenberg, R.* ; Vucini, E.* ; Krestin, G.P.* ; Niessen, W.J.* ; van Walsum, T.*
Standardized evaluation framework for evaluating coronary artery stenosis detection, stenosis quantification and lumen segmentation algorithms in computed tomography angiography.
Med. Image Anal. 17, 859-876 (2013)
Kuklisova-Murgasova, M.* ; Cifor, A.* ; Napolitano, R.* ; Papageorghiou, A.* ; Quaghebeur, G.* ; Rutherford, M.A.* ; Hajnal, J.V.* ; Noble, J.A.* ; Schnabel, J.A.*
Registration of 3D fetal neurosonography and MRI.
Med. Image Anal. 17, 1137-1150 (2013)
Risser, L.* ; Vialard, F.X.* ; Baluwala, H.Y.* ; Schnabel, J.A.*
Piecewise-diffeomorphic image registration: Application to the motion estimation between 3D CT lung images with sliding conditions.
Med. Image Anal. 17, 182-193 (2013)
Vogel, J.* ; Lasser, T. ; Gardiazabal, J.* ; Navab, N.*
Trajectory optimization for intra-operative nuclear tomographic imaging.
Med. Image Anal. 17, 723-731 (2013)
Heinrich, M.P.* ; Jenkinson, M.* ; Bhushan, M.* ; Matin, T.* ; Gleeson, F.V.* ; Brady, S.M.* ; Schnabel, J.A.*
MIND: Modality independent neighbourhood descriptor for multi-modal deformable registration.
Med. Image Anal. 16, 1423-1435 (2012)
Kuklisova-Murgasova, M.* ; Quaghebeur, G.* ; Rutherford, M.A.* ; Hajnal, J.V.* ; Schnabel, J.A.*
Reconstruction of fetal brain MRI with intensity matching and complete outlier removal.
Med. Image Anal. 16, 1550-1564 (2012)