Kasmanas, J.C.* ; Magnúsdóttir, S.* ; Zhang, J.* ; Smalla, K.* ; Schloter, M. ; Stadler, P.F.* ; de Leon Ferreira de Carvalho, A.C.P.* ; Rocha, U.*
Integrating comparative genomics and risk classification by assessing virulence, antimicrobial resistance, and plasmid spread in microbial communities with gSpreadComp.
GigaScience 14:giaf072 (2025)
Tucholski, T.* ; Maennel, A.* ; Njipouombe Nsangou, Y.A. ; Schuchardt, S.* ; Gruber, M.* ; Kellermeier, F.* ; Dettmer, K.* ; Oefner, P.J.* ; Gronwald, W.* ; Altenbuchinger, M.* ; Dönitz, J. ; Zacharias, H.U.*
MetaboSERV-a platform for selecting, exchanging, and visualizing metabolomics data with controlled data access.
GigaScience 14:giaf075 (2025)
Hamdan, S.* ; Love, B.C.* ; von Polier, G.G.* ; Weis, S.* ; Schwender, H.* ; Eickhoff, S.B.* ; Patil, K.R.*
Confound-leakage: confound removal in machine learning leads to leakage.
GigaScience 12, 14 (2023)
Tsepilov, Y.A.* ; Sharapov, S.Z.* ; Zaytseva, O.O.* ; Krumsiek, J. ; Prehn, C. ; Adamski, J. ; Kastenmüller, G. ; Wang-Sattler, R. ; Strauch, K. ; Gieger, C. ; Aulchenko, Y.S.*
A network-based conditional genetic association analysis of the human metabolome (vol 7, gij137, 2018).
GigaScience 8:giz162 (2019)
Simon, L. ; Karg, S. ; Westermann, A.J.* ; Engel, M. ; Elbehery, A.H.A. ; Hense, B.A. ; Heinig, M. ; Deng, L. ; Theis, F.J.
MetaMap: An atlas of metatranscriptomic reads in human disease-related RNA-seq data.
GigaScience 7, 1-8 (2018)
Tsepilov, Y.A.* ; Sharapov, S.Z.* ; Zaytseva, O.O.* ; Krumsiek, J. ; Prehn, C. ; Adamski, J. ; Kastenmüller, G. ; Wang-Sattler, R. ; Strauch, K. ; Gieger, C. ; Aulchenko, Y.S.*
A network-based conditional genetic association analysis of the human metabolome.
GigaScience 7, DOI: 10.1093/gigascience/giy137 (2018)
Oetjen, J.* ; Veselkov, K.* ; Watrous, J.* ; McKenzie, J.S.* ; Becker, M.* ; Hauberg-Lotte, L.* ; Kobarg, J.H.* ; Strittmatter, N.* ; Mróz, A.K.* ; Hoffmann, F.* ; Trede, D.* ; Palmer, A.* ; Schiffler, S.* ; Steinhorst, K.* ; Aichler, M. ; Goldin, R.* ; Guntinas-Lichius, O.* ; von Eggeling, F.* ; Thiele, H.* ; Maedler, K.* ; Walch, A.K. ; Maass, P.* ; Dorrestein, P.C.* ; Takats, Z.* ; Alexandrov, T.*
Benchmark datasets for 3D MALDI- and DESI-imaging mass spectrometry.
GigaScience 4:20 (2015)