Burankova, Y.* ; Abele, M.* ; Bakhtiari, M.* ; von Toerne, C. ; Barth, T.K.* ; Schweizer, L.* ; Giesbertz, P.* ; Schmidt, J.R.* ; Kalkhof, S.* ; Müller-Deile, J.* ; van Veelen, P.A.* ; Mohammed, Y.* ; Hammer, E.* ; Arend, L.* ; Adamowicz, K.* ; Laske, T.* ; Hartebrodt, A.* ; Frisch, T.* ; Meng, C.* ; Matschinske, J.* ; Späth, J.* ; Röttger, R.* ; Schwämmle, V.* ; Hauck, S.M. ; Lichtenthaler, S.F.* ; Imhof, A.* ; Mann, M.* ; Ludwig, C.* ; Kuster, B.* ; Baumbach, J.* ; Zolotareva, O.*
Privacy-preserving multicenter differential protein abundance analysis with FedProt.
Nat. Comput. Sci., DOI: 10.1038/s43588-025-00832-7 (2025)
Miladinovic, D.* ; Höppe, T. ; Chevalley, M.* ; Georgiou, A.* ; Stuart, L.* ; Mehrjou, A.* ; Bantscheff, M.* ; Schölkopf, B.* ; Schwab, P.*
In silico biological discovery with large perturbation models.
Nat. Comput. Sci., DOI: 10.1038/s43588-025-00870-1 (2025)
Siebenmorgen, T. ; Cardoso Micu Menezes, F.M. ; Benassou, S.* ; Merdivan, E. ; Didi, K.* ; Mourao, A. ; Kitel, R.* ; Liò, P.* ; Kesselheim, S.* ; Piraud, M. ; Theis, F.J. ; Sattler, M. ; Popowicz, G.M.
MISATO: Machine learning dataset of protein-ligand complexes for structure-based drug discovery.
Nat. Comput. Sci. 4, 367–378 (2024)