Lextrait, G.* ; Joardar, S. ; Cossard, R.* ; Kikuchi, Y.* ; Ohbayashi, T.* ; Mergaert, P.*
Strict gut symbiont specificity in Coreoidea insects governed by interspecies competition within Caballeronia strains.
ISME J. 19:wraf240 (2025)
Kang-Yun, C.S.* ; Liang, X.* ; Dershwitz, P.* ; Gu, W.* ; Schepers, A. ; Flatley, A. ; Lichtmannegger, J. ; Zischka, H. ; Zhang, L.* ; Lu, X.* ; Gu, B.* ; Ledesma, J.C.* ; Pelger, D.J.* ; DiSpirito, A.A.* ; Semrau, J.D.*
Evidence for methanobactin "Theft" and novel chalkophore production in methanotrophs: Impact on methanotrophic-mediated methylmercury degradation.
ISME J. 16, 211–220 (2022)
Broadbent, A.A.D.* ; Snell, H.S.K.* ; Michas, A. ; Pritchard, W.J.* ; Newbold, L.* ; Cordero, I.* ; Goodall, T.* ; Schallhart, N.* ; Kaufmann, R.* ; Griffiths, R.I.* ; Schloter, M. ; Bahn, M.* ; Bardgett, R.D.*
Climate change alters temporal dynamics of alpine soil microbial functioning and biogeochemical cycling via earlier snowmelt.
ISME J. 15, 2264–2275 (2021)
Klatt, J.M.* ; Gomez-Saez, G.V.* ; Meyer, S.* ; Ristova, P.P.* ; Yilmaz, P.* ; Granitsiotis, M.S. ; Macalady, J.L.* ; Lavik, G.* ; Polerecky, L.* ; Bühring, S.I.*
Versatile cyanobacteria control the timing and extent of sulfide production in a Proterozoic analog microbial mat.
ISME J. 14, 3024-3037 (2020)
Müller, H.* ; Marozava, S. ; Probst, A.J.* ; Meckenstock, R.U.*
Groundwater cable bacteria conserve energy by sulfur disproportionation.
ISME J. 14, 623-634 (2020)
Kundu, K. ; Marozava, S. ; Ehrl, B. ; Merl-Pham, J. ; Griebler, C. ; Elsner, M.
Defining lower limits of biodegradation: atrazine degradation regulated by mass transfer and maintenance demand in Arthrobacter aurescens TC1.
ISME J. 13, 2236-2251 (2019)
Kundu, K. ; Marozava, S. ; Ehrl, B. ; Merl-Pham, J. ; Griebler, C. ; Elsner, M.
Defining lower limits of biodegradation: Atrazine degradation regulated by mass transfer and maintenance demand in Arthrobacter aurescens TC1 (vol 13, pg 2236, 2019).
ISME J. 14, 323-323 (2019)
Zhao, Z.* ; Gonsior, M.* ; Schmitt-Kopplin, P. ; Zhan, Y.* ; Zhang, R.* ; Jiao, N.* ; Chen, F.*
Microbial transformation of virus-induced dissolved organic matter from picocyanobacteria: Coupling of bacterial diversity and DOM chemodiversity.
ISME J. 13, 2551–2565 (2019)
Dong, X. ; Greening, C.* ; Brüls, T.* ; Conrad, R.* ; Guo, K.* ; Blaskowski, S.* ; Kaschani, F.* ; Kaiser, M.* ; Laban, N.A.* ; Meckenstock, R.U.*
Fermentative Spirochaetes mediate necromass recycling in anoxic hydrocarbon-contaminated habitats.
ISME J. 12, 2039-2050 (2018)
Karwautz, C. ; Kus, G.* ; Stöckl, M. ; Neu, T.R.* ; Lueders, T.
Microbial megacities fueled by methane oxidation in a mineral spring cave.
ISME J. 12, 87-100 (2018)
Toyofuku, M.* ; Morinaga, K.* ; Hashimoto, Y.* ; Uhl, J. ; Shimamura, H.* ; Inaba, H.* ; Schmitt-Kopplin, P. ; Eberl, L.* ; Nomura, N.*
Membrane vesicle-mediated bacterial communication.
ISME J. 11, 1504-1509 (2017)
Glaeser, S.P.* ; Imani, J.* ; Alabid, I.* ; Guo, H.* ; Kumar, N.* ; Kämpfer, P.* ; Hardt, M.* ; Blom, J.* ; Goesmann, A.* ; Rothballer, M. ; Hartmann, A. ; Kogel, K.-H.*
Non-pathogenic Rhizobium radiobacter F4 deploys plant beneficial activity independent of its host Piriformospora indica.
ISME J. 10, 871-884 (2016)
Müller, H. ; Bosch, J. ; Griebler, C. ; Damgaard, L.R.* ; Nielsen, L.P.* ; Lueders, T. ; Meckenstock, R.U.
Long-distance electron transfer by cable bacteria in aquifer sediments.
ISME J. 10, 2010-2019 (2016)
Kurmayer, R.* ; Blom, J.F.* ; Deng, L. ; Pernthaler, J.*
Integrating phylogeny, geographic niche partitioning and secondary metabolite synthesis in bloom-forming Planktothrix.
ISME J. 9, 909-921 (2015)
Steinbach, A.* ; Schulz, S. ; Giebler, J.* ; Schulz, S. ; Pronk, G.J.* ; Kögel-Knabner, I.* ; Harms, H.* ; Wick, L.Y.* ; Schloter, M.
Clay minerals and metal oxides strongly influence the structure of alkane-degrading microbial communities during soil maturation.
ISME J. 9, 1687-1691 (2015)
Tedersoo, L.* ; Bahram, M.* ; Cajthaml, T.* ; Polme, S.* ; Hiiesalu, I.* ; Anslan, S.* ; Harend, H.* ; Buegger, F. ; Pritsch, K. ; Koricheva, J.* ; Abarenkov, K.*
Tree diversity and species identity effects on soil fungi, protists and animals are context dependent.
ISME J. 10, 346-362 (2015)
Daniel, H.* ; Gholami, A.M.* ; Berry, D.* ; Desmarchelier, C.* ; Hahne, H.* ; Loh, G.* ; Mondot, S.* ; Lepage, P.* ; Rothballer, M. ; Walker, A.* ; Böhm, C.* ; Wenning, M.* ; Wagner, M.* ; Blaut, M.* ; Schmitt-Kopplin, P. ; Kuster, B.* ; Haller, D.* ; Clavel, T.*
High-fat diet alters gut microbiota physiology in mice.
ISME J. 8, 295–308 (2014)
Kleindienst, S.* ; Herbst, F.A.* ; Stagars, M.* ; von Netzer, F. ; von Bergen, M.* ; Seifert, J.* ; Peplies, J.* ; Amann, R.* ; Musat, F.* ; Lueders, T. ; Knittel, K.*
Diverse sulfate-reducing bacteria of the Desulfosarcina/Desulfococcus clade are the key alkane degraders at marine seeps.
ISME J. 8, 2029-2044 (2014)
Walker, A. ; Pfitzner, B. ; Neschen, S. ; Kahle-Stephan, M. ; Harir, M. ; Lucio, M. ; Moritz, F. ; Tziotis, D. ; Witting, M. ; Rothballer, M. ; Engel, M. ; Schmid, M. ; Endesfelder, D. ; Klingenspor, M. ; Rattei, T.* ; zu Castell, W. ; Hrabě de Angelis, M. ; Hartmann, A. ; Schmitt-Kopplin, P.
Distinct signatures of host-microbial meta-metabolome and gut microbiome in two C57BL/6 strains under high-fat diet.
ISME J. 8, 2380-2396 (2014)
Berry, D.* ; Schwab, C.* ; Milinovich, G.* ; Reichert, J.* ; Ben Mahfoudh, K.* ; Decker, T.-M.* ; Engel, M. ; Hai, B. ; Hainzl, E.* ; Heider, S.* ; Kenner, L.* ; Müller, M.* ; Rauch, I.* ; Strobl, B.* ; Wagner, M.* ; Schleper, C.* ; Urich, T.* ; Loy, A.*
Phylotype-level 16S rRNA analysis reveals new bacterial indicators of health state in acute murine colitis.
ISME J. 6, 2091-2106 (2012)
Schulz, S. ; Giebler, J.* ; Chatzinotas, A.* ; Wick, L.Y.* ; Fetzer, I.* ; Welzl, G. ; Harms, H.* ; Schloter, M.
Plant litter and soil type drive abundance, activity and community structure of alkB harbouring microbes in different soil compartments.
ISME J. 6, 1763-1774 (2012)
Brankatsch, R.* ; Töwe, S.* ; Kleineidam, K. ; Schloter, M. ; Zeyer, J.*
Abundances and potential activities of nitrogen cycling microbial communities along a chronosequence of a glacier forefield.
ISME J. 5, 1025-1037 (2011)
Engel, A.S.* ; Meisinger, D.B.* ; Porter, M.L.* ; Payn, R.A.* ; Schmid, M. ; Stern, L.A.* ; Schleifer, K.H.* ; Lee, N.M.*
Linking phylogenetic and functional diversity to nutrient spiraling in microbial mats from Lower Kane Cave (USA).
ISME J. 4, 98-110 (2010)
Peña, A.* ; Teeling, H.* ; Huerta-Cepas, J.* ; Santos, F.* ; Yarza, P.* ; Brito-Echeverría, J.* ; Lucio, M. ; Schmitt-Kopplin, P. ; Meseguer, I.* ; Schenowitz, C.* ; Dossat, C.* ; Barbe, V.* ; Dopazo, J.* ; Rosselló-Mora, R.* ; Schüler, M.* ; Glöckner, F.O.* ; Amann, R.* ; Gabaldón, T.* ; Antón, J.*
Fine-scale evolution: Genomic, phenotypic and ecological differentiation in two coexisting Salinibacter ruber strains.
ISME J. 4, 882-895 (2010)
Winderl, C. ; Penning, H. ; von Netzer, F. ; Meckenstock, R.U. ; Lüders, T.
DNA-SIP identifies sulfate-reducing Clostridia as important toluene degraders in tar-oil-contaminated aquifer sediment.
ISME J. 4, 1314-1325 (2010)
Hallin, S.* ; Jones, C.M.* ; Schloter, M. ; Philippot, L.*
Relationship between N-cycling communities and ecosystem functioning in a 50-year-old fertilization experiment.
ISME J. 3, 597-605 (2009)
Hesselsoe, M.* ; Füreder, S.* ; Schloter, M. ; Bodrossy, L.* ; Iversen, N.* ; Roslev, P.* ; Nielsen, P.H.* ; Wagner, M.* ; Loy, A.*
Isotope array analysis of Rhodocyclales uncovers functional redundancy and versatility in an activated sludge.
ISME J. 3, 1349-1364 (2009)
Rosenberg, K.* ; Bertaux, J.* ; Krome, K.* ; Hartmann, A. ; Scheu, S.* ; Bonkowski, M.*
Soil amoebae rapidly change bacterial community composition in the rhizosphere of Arabidopsis thaliana.
ISME J. 3, 675-684 (2009)
Le Roux, X.* ; Poly, F.* ; Currey, P.* ; Commeaux, C.* ; Hai, B. ; Nicol, G.W.* ; Prosser, J.I.* ; Schloter, M. ; Attard, E.* ; Klumpp, K.*
Effects of aboveground grazing on coupling among nitrifier activity, abundance and community structure.
ISME J. 2, 221-232 (2008)
Rosselló-Mora, R.* ; Lucio, M. ; Peña, A.* ; Brito-Echeverría, J.* ; López-López, A.* ; Valens-Vadell, M.* ; Frommberger, M. ; Antón, J.* ; Schmitt-Kopplin, P.
Metabolic evidence for biogeographic isolation of the extremophilic bacterium Salinibacter ruber.
ISME J. 2, 242-253 (2008)
Kunapuli, U. ; Lüders, T. ; Meckenstock, R.U.
The use of stable isotope probing to identify key iron-reducing microorganisms involved in anaerobic benzene degradation.
ISME J. 1, 643-653 (2007)
Radl, V.* ; Gattinger, A. ; Chronakova, A.* ; Nemcová, A.* ; Cuhel, J.* ; Simek, M.* ; Munch, J.-C. ; Schloter, M. ; Elhottova, D.*
Effects of cattle husbandry on abundance and activity of methanogenic archaea in upland soils.
ISME J. 1, 443-452 (2007)