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Bio- and chemoinformatics approaches for metabolomics data analysis.
Methods Mol. Biol. 1738, 41-61 (2018)
Metabolomics data analysis includes several repetitive tasks, including data sorting, calculation of exact masses or other physicochemical properties, or searching for identifiers in different databases. Several of these tasks can be automated using command line tools or short scripts in different scripting languages like Perl, Python, or R. This chapter presents simple solutions and short scripts written in R that can be used for the interaction with specific web services or for the calculation of physicochemical properties or molecular formulae.
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3
Anmerkungen
Besondere Publikation
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Publikationstyp
Artikel: Journalartikel
Dokumenttyp
Wissenschaftlicher Artikel
Schlagwörter
Command Line ; Formula Calculation ; Identifier Conversion ; Physicochemical Properties ; R, Isotope Pattern ; Web Service
Sprache
englisch
Veröffentlichungsjahr
2018
HGF-Berichtsjahr
2018
ISSN (print) / ISBN
1064-3745
e-ISSN
1940-6029
Bandtitel
Metabolic Profiling
Zeitschrift
Methods in Molecular Biology
Quellenangaben
Band: 1738,
Seiten: 41-61
Verlag
Springer
Verlagsort
Berlin [u.a.]
Begutachtungsstatus
Peer reviewed
POF Topic(s)
30202 - Environmental Health
Forschungsfeld(er)
Environmental Sciences
PSP-Element(e)
G-504800-001
Scopus ID
85045504905
Erfassungsdatum
2018-07-13