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Protein-coding variants implicate novel genes related to lipid homeostasis contributing to body-fat distribution.

Nat. Genet. 51, 452–469 (2019)
Postprint DOI PMC
Open Access Green
Body-fat distribution is a risk factor for adverse cardiovascular health consequences. We analyzed the association of body-fat distribution, assessed by waist-to-hip ratio adjusted for body mass index, with 228,985 predicted coding and splice site variants available on exome arrays in up to 344,369 individuals from five major ancestries (discovery) and 132,177 European-ancestry individuals (validation). We identified 15 common (minor allele frequency, MAF >= 5%) and nine low-frequency or rare (MAF < 5%) coding novel variants. Pathway/gene set enrichment analyses identified lipid particle, adiponectin, abnormal white adipose tissue physiology and bone development and morphology as important contributors to fat distribution, while cross-trait associations highlight cardiometabolic traits. In functional follow-up analyses, specifically in Drosophila RNAi-knockdowns, we observed a significant increase in the total body triglyceride levels for two genes (DNAH10 and PLXND1). We implicate novel genes in fat distribution, stressing the importance of interrogating low-frequency and protein-coding variants.
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Publikationstyp Artikel: Journalartikel
Dokumenttyp Wissenschaftlicher Artikel
Schlagwörter Genome-wide Association; Type-2 Diabetes Susceptibility; Adipose-tissue; Kinase 7; Adipocyte Differentiation; Rs11209026 Polymorphism; Abdominal Adiposity; Waist Circumference; Insulin-resistance; Receptor Alk7
Sprache englisch
Veröffentlichungsjahr 2019
HGF-Berichtsjahr 2019
ISSN (print) / ISBN 1061-4036
e-ISSN 1546-1718
Zeitschrift Nature Genetics
Quellenangaben Band: 51, Heft: 3, Seiten: 452–469 Artikelnummer: , Supplement: ,
Verlag Nature Publishing Group
Verlagsort New York, NY
Begutachtungsstatus Peer reviewed
Institut(e) Institute of Epidemiology (EPI)
Institute of Genetic Epidemiology (IGE)
POF Topic(s) 30202 - Environmental Health
30501 - Systemic Analysis of Genetic and Environmental Factors that Impact Health
Forschungsfeld(er) Genetics and Epidemiology
PSP-Element(e) G-504091-002
G-504000-007
G-504100-001
DOI 10.1038/s41588-018-0334-2
WOS ID WOS:000459947200014
Scopus ID 85061697378
PubMed ID 30778226
Erfassungsdatum 2019-02-27
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