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Genome-wide association study of renal cell carcinoma identifies two susceptibility loci on 2p21 and 11q13.3.

Nat. Genet. 43, 60-65 (2011)
DOI PMC
Open Access Green möglich sobald Postprint bei der ZB eingereicht worden ist.
We conducted a two-stage genome-wide association study of renal cell carcinoma (RCC) in 3,772 affected individuals (cases) and 8,505 controls of European background from 11 studies and followed up 6 SNPs in 3 replication studies of 2,198 cases and 4,918 controls. Two loci on the regions of 2p21 and 11q13.3 were associated with RCC susceptibility below genome-wide significance. Two correlated variants (r² = 0.99 in controls), rs11894252 (P = 1.8 × 10⁻⁸) and rs7579899 (P = 2.3 × 10⁻⁹), map to EPAS1 on 2p21, which encodes hypoxia-inducible-factor-2 alpha, a transcription factor previously implicated in RCC. The second locus, rs7105934, at 11q13.3, contains no characterized genes (P = 7.8 × 10⁻¹⁴). In addition, we observed a promising association on 12q24.31 for rs4765623, which maps to SCARB1, the scavenger receptor class B, member 1 gene (P = 2.6 × 10⁻⁸). Our study reports previously unidentified genomic regions associated with RCC risk that may lead to new etiological insights.
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Publikationstyp Artikel: Journalartikel
Dokumenttyp Wissenschaftlicher Artikel
Korrespondenzautor
Schlagwörter no keywords
ISSN (print) / ISBN 1061-4036
e-ISSN 1546-1718
Zeitschrift Nature Genetics
Quellenangaben Band: 43, Heft: 1, Seiten: 60-65 Artikelnummer: , Supplement: ,
Verlag Nature Publishing Group
Verlagsort New York, NY
Nichtpatentliteratur Publikationen
Begutachtungsstatus Peer reviewed
Institut(e) Institute of Epidemiology (EPI)