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Jouffe, C. ; Dyar, K.A. ; Uhlenhaut, N.H.

Chromatin immunoprecipitation in adipose tissue and adipocytes: How to proceed and optimize the protocol for transcription factor DNA binding.

In: Chromatin Immunoprecipitation. Berlin [u.a.]: Springer, 2024. 35-45 (Methods Mol. Biol. ; 2846)
DOI PMC
Chromatin immunoprecipitation (ChIP) coupled to qPCR or sequencing is a crucial experiment to determine direct transcriptional regulation under the control of specific transcriptional factors or co-regulators at loci-specific or pan-genomic levels.Here we provide a reliable method for processing ChIP from adipocytes or frozen adipose tissue collection, isolation of nuclei, cross-linking of protein-DNA complexes, chromatin shearing, immunoprecipitation, and DNA purification. We also discuss critical steps for optimizing the experiment to perform a successful ChIP in lipid-rich cells/tissues.
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Publikationstyp Artikel: Sammelbandbeitrag/Buchkapitel
Schlagwörter Adipocyte ; Adipose Tissue ; Chip ; Chromatin Immunoprecipitation
Sprache englisch
Veröffentlichungsjahr 2024
HGF-Berichtsjahr 2024
ISSN (print) / ISBN 1064-3745
e-ISSN 1940-6029
Bandtitel Chromatin Immunoprecipitation
Zeitschrift Methods in Molecular Biology
Quellenangaben Band: 2846, Heft: , Seiten: 35-45 Artikelnummer: , Supplement: ,
Verlag Springer
Verlagsort Berlin [u.a.]
Begutachtungsstatus Peer reviewed
Institut(e) Institute of Diabetes and Endocrinology (IDE)
Institute of Diabetes and Cancer (IDC)
POF Topic(s) 30202 - Environmental Health
30201 - Metabolic Health
Forschungsfeld(er)
Helmholtz Diabetes Center
PSP-Element(e) G-501900-259
G-502594-001
DOI 10.1007/978-1-0716-4071-5_3
Scopus ID 85201250364
PubMed ID 39141228
Erfassungsdatum 2024-10-01
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