PuSH - Publikationsserver des Helmholtz Zentrums München

Export: TXT Text RIS Endnote (RIS) BIB BibTeX
Sato, S.* ; Tabata, S.* ; Hirakawa, H.* ; Asamizu, E.* ; Shirasawa, K.* ; Isobe, S.* ; Kaneko, T.* ; Nakamura, Y.* ; Shibata, D.* ; Aoki, K.* ; Egholm, M.* ; Knight, J.* ; Bogden, R.* ; Li, C.B.* ; Shuang, Y.* ; Xu, X.* ; Pan, S.K.* ; Cheng, S.F.* ; Liu, X.* ; Ren, Y.Y.* ; Wang, J.* ; Albiero, A.* ; Dal Pero, F.* ; Todesco, S.* ; van Eck, J.* ; Buels, R.M.* ; Bombarely, A.* ; Gosselin, J.R.* ; Huang, M.Y.* ; Leto, J.A.* ; Menda, N.* ; Strickler, S.* ; Mao, L.Y.* ; Gao, S.* ; Tecle, I.Y.* ; York, T.* ; Zheng, Y.* ; Vrebalov, J.T.* ; Lee, J.* ; Zhong, S.L.* ; Mueller, L.A.* ; Stiekema, W.J.* ; Ribeca, P.* ; Alioto, T.* ; Yang, W.C.* ; Huang, S.W.* ; Du, Y.C.* ; Zhang, Z.H.* ; Gao, J.C.* ; Guo, Y.M.* ; Wang, X.X.* ; Li, Y.* ; He, J.* ; Li, C.Y.* ; Cheng, Z.K.* ; Zuo, J.R.* ; Ren, J.F.* ; Zhao, J.H.* ; Yan, L.H.* ; Jiang, H.L.* ; Wang, B.* ; Li, H.S.* ; Li, Z.J.* ; Fu, F.Y.* ; Chen, B.T.* ; Han, B.* ; Feng, Q.* ; Fan, D.L.* ; Wang, Y.* ; Ling, H.Q.* ; Xue, Y.B.A.* ; Ware, D.* ; McCombie, W.R.* ; Lippman, Z.B.* ; Chia, J.M.* ; Jiang, K.* ; Pasternak, S.* ; Gelley, L.* ; Kramer, M.* ; Anderson, L.K.* ; Chang, S.B.* ; Royer, S.M.* ; Shearer, L.A.* ; Stack, S.M.* ; Rose, J.K.C.* ; Xu, Y.M.* ; Eannetta, N.* ; Matas, A.J.* ; McQuinn, R.* ; Tanksley, S.D.* ; Camara, F.* ; Guigo, R.* ; Rombauts, S.* ; Fawcett, J.* ; van de Peer, Y.* ; Zamir, D.* ; Liang, C.B.* ; Spannagl, M. ; Gundlach, H. ; Bruggmann, R. ; Mayer, K.F.X. ; Jia, Z.Q.* ; Zhang, J.H.* ; Ye, Z.B.A.* ; Bishop, G.J.* ; Butcher, S.* ; Lopez-Cobollo, R.* ; Buchan, D.* ; Filippis, I.* ; Abbott, J.* ; Dixit, R.* ; Singh, M.* ; Singh, A.* ; Pal, J.K.* ; Pandit, A.* ; Singh, P.K.* ; Mahato, A.K.* ; Dogra, V.* ; Gaikwad, K.* ; Sharma, T.R.* ; Mohapatra, T.* ; Singh, N.K.* ; Causse, M.* ; Rothan, C.* ; Schiex, T.* ; Noirot, C.* ; Bellec, A.* ; Klopp, C.* ; Delalande, C.* ; Bergès, H.* ; Mariette, J.* ; Frasse, P.* ; Vautrin, S.* ; Zouine, M.* ; Latche, A.* ; Rousseau, C.* ; Regad, F.* ; Pech, J.C.* ; Philippot, M.* ; Bouzayen, M.* ; Pericard, P.* ; Osorio, S.* ; del Carmen, A.F.* ; Monforte, A.* ; Granell, A.* ; Fernandez-Munoz, R.* ; Conte, M.* ; Lichtenstein, G.* ; Carrari, F.* ; de Bellis, G.* ; Fuligni, F.* ; Peano, C.* ; Grandillo, S.* ; Termolino, P.* ; Pietrella, M.* ; Fantini, E.* ; Falcone, G.* ; Fiore, A.* ; Giuliano, G.* ; Lopez, L.* ; Facella, P.* ; Perrotta, G.* ; Daddiego, L.* ; Bryan, G.* ; Orozco, M.* ; Pastor, X.* ; Torrents, D.* ; van Schriek, K.N.V.M.G.M.* ; Feron, R.M.C.* ; van Oeveren, J.* ; de Heer, P.* ; daPonte, L.* ; Jacobs-Oomen, S.* ; Cariaso, M.* ; Prins, M.* ; van Eijk, M.J.T.* ; Janssen, A.* ; van Haaren, M.J.J.* ; Jo, S.H.* ; Kim, J.* ; Kwon, S.Y.* ; Kim, S.* ; Koo, D.H.* ; Lee, S.* ; Hur, C.G.* ; Clouser, C.* ; Rico, A.* ; Hallab, A.* ; Gebhardt, C.* ; Klee, K.* ; Jöcker, A.* ; Warfsmann, J.* ; Gobel, U.* ; Kawamura, S.* ; Yano, K.* ; Sherman, J.D.* ; Fukuoka, H.* ; Negoro, S.* ; Bhutty, S.* ; Chowdhury, P.* ; Chattopadhyay, D.* ; Datema, E.* ; Smit, S.* ; Schijlen, E.W.M.* ; van de Belt, J.* ; van Haarst, J.C.* ; Peters, S.A.* ; van Staveren, M.J.* ; Henkens, M.H.C.* ; Mooyman, P.J.W.* ; Hesselink, T.* ; van Ham, R.C.H.J.* ; Jiang, G.Y.* ; Droege, M.* ; Choi, D.* ; Kang, B.C.* ; Kim, B.D.* ; Park, M.* ; Yeom, S.I.* ; Lee, Y.H.* ; Choi, Y.D.* ; Li, G.C.* ; Gao, J.W.* ; Liu, Y.S.* ; Huang, S.X.* ; Fernandez-Pedrosa, V.* ; Collado, C.* ; Zuniga, S.* ; Wang, G.P.* ; Cade, R.* ; Dietrich, R.A.* ; Rogers, J.* ; Knapp, S.* ; Fei, Z.J.* ; White, R.A.* ; Thannhauser, T.W.* ; Giovannoni, J.J.* ; Botella, M.A.* ; Gilbert, L.* ; González, R.* ; Goicoechea, J.L.* ; Yu, Y.* ; Kudrna, D.* ; Collura, K.* ; Wissotski, M.* ; Wing, R.* ; Schoof, H.* ; Meyers, B.C.* ; Gurazada, A.B.* ; Green, P.J.* ; Mathur, S.* ; Vyas, S.* ; Solanke, A.U.* ; Kumar, R.* ; Gupta, V.* ; Sharma, A.K.* ; Khurana, P.* ; Khurana, J.P.* ; Tyagi, A.K.* ; Dalmay, T.* ; Mohorianu, I.* ; Walts, B.* ; Chamala, S.* ; Barbazuk, W.B.* ; Li, J.P.* ; Guo, H.* ; Lee, T.H.* ; Wang, Y.P.* ; Zhang, D.* ; Paterson, A.H.* ; Wang, X.Y.* ; Tang, H.B.* ; Barone, A.* ; Chiusano, M.L.* ; Ercolano, M.R.* ; D'Agostino, N.* ; di Filippo, M.* ; Traini, A.* ; Sanseverino, W.* ; Frusciante, L.* ; Seymour, G.B.* ; Elharam, M.* ; Fu, Y.* ; Hua, A.* ; Kenton, S.* ; Lewis, J.* ; Lin, S.P.* ; Najar, F.* ; Lai, H.S.* ; Qin, B.F.* ; Qu, C.M.* ; Shi, R.H.* ; White, D.* ; White, J.* ; Xing, Y.B.* ; Yang, K.Q.* ; Yi, J.* ; Yao, Z.Y.* ; Zhou, L.P.* ; Roe, B.A.* ; Vezzi, A.* ; D'Angelo, M.* ; Zimbello, R.* ; Schiavon, R.* ; Caniato, E.* ; Rigobello, C.* ; Campagna, D.* ; Vitulo, N.* ; Valle, G.* ; Nelson, D.R.* ; de Paoli, E.* ; Szinay, D.* ; de Jong, H.H.* ; Bai, Y.L.* ; Visser, R.G.F.* ; Lankhorst, R.M.K.* ; Beasley, H.* ; McLaren, K.* ; Nicholson, C.* ; Riddle, C.* ; Gianese, G.* ; Tomato Genome Consortium (*)

The tomato genome sequence provides insights into fleshy fruit evolution.

Nature 485, 635-641 (2012)
Verlagsversion Volltext DOI PMC
Closed
Open Access Green möglich sobald Postprint bei der ZB eingereicht worden ist.
Tomato (Solanum lycopersicum) is a major crop plant and a model system for fruit development. Solanum is one of the largest angiosperm genera(1) and includes annual and perennial plants from diverse habitats. Here we present a high-quality genome sequence of domesticated tomato, a draft sequence of its closest wild relative, Solanum pimpinellifolium(2), and compare them to each other and to the potato genome (Solanum tuberosum). The two tomato genomes show only 0.6% nucleotide divergence and signs of recent admixture, but show more than 8% divergence from potato, with nine large and several smaller inversions. In contrast to Arabidopsis, but similar to soybean, tomato and potato small RNAs map predominantly to gene-rich chromosomal regions, including gene promoters. The Solanum lineage has experienced two consecutive genome triplications: one that is ancient and shared with rosids, and a more recent one. These triplications set the stage for the neofunctionalization of genes controlling fruit characteristics, such as colour and fleshiness.
Impact Factor
Scopus SNIP
Web of Science
Times Cited
Scopus
Cited By
Altmetric
36.280
8.680
1067
2191
Tags
Anmerkungen
Besondere Publikation
Auf Hompepage verbergern

Zusatzinfos bearbeiten
Eigene Tags bearbeiten
Privat
Eigene Anmerkung bearbeiten
Privat
Auf Publikationslisten für
Homepage nicht anzeigen
Als besondere Publikation
markieren
Publikationstyp Artikel: Journalartikel
Dokumenttyp Wissenschaftlicher Artikel
Schlagwörter LYCOPERSICON-ESCULENTUM; GENE; DIVERSIFICATION; ARABIDOPSIS; PATTERNS; ORTHOLOG; HISTORY; SORGHUM; POTATO
Sprache englisch
Veröffentlichungsjahr 2012
HGF-Berichtsjahr 2012
ISSN (print) / ISBN 0028-0836
e-ISSN 1476-4687
Zeitschrift Nature
Quellenangaben Band: 485, Heft: 7400, Seiten: 635-641 Artikelnummer: , Supplement: ,
Verlag Nature Publishing Group
Verlagsort London
Begutachtungsstatus Peer reviewed
Institut(e) Institute of Bioinformatics and Systems Biology (IBIS)
PSP-Element(e) G-503700-002
PubMed ID 22660326
DOI 10.1038/nature11119
Scopus ID 84863693752
Erfassungsdatum 2012-07-23
[➜Korrektur melden]