PuSH - Publikationsserver des Helmholtz Zentrums München

Export: TXT Text RIS Endnote (RIS) BIB BibTeX
Moore, J.* ; Basurto-Lozada, D.* ; Besson, S.* ; Bogovic, J.* ; Bragantini, J.* ; Brown, E.M.* ; Burel, J.M.* ; Casas Moreno, X.* ; de Medeiros, G.* ; Diel, E.E.* ; Gault, D.* ; Ghosh, S.S.* ; Gold, I.* ; Halchenko, Y.O.* ; Hartley, M.* ; Horsfall, D.* ; Keller, M.S.* ; Kittisopikul, M.* ; Kovács, G.* ; Küpcü Yoldaş, A.* ; Kyoda, K.* ; le Tournoulx de la Villegeorges, A.* ; Li, T.* ; Liberali, P.* ; Lindner, D.* ; Linkert, M.* ; Lüthi, J.* ; Maitin-Shepard, J.* ; Manz, T.* ; Marconato, L.* ; McCormick, M.* ; Lange, M.* ; Mohamed, K.* ; Moore, W.* ; Norlin, N.* ; Ouyang, W.* ; Özdemir, B.* ; Palla, G. ; Pape, C.* ; Pelkmans, L.* ; Pietzsch, T.* ; Preibisch, S.* ; Prete, M.* ; Rzepka, N.* ; Samee, S.* ; Schaub, N.* ; Sidky, H.* ; Solak, A.C.* ; Stirling, D.R.* ; Striebel, J.* ; Tischer, C.* ; Toloudis, D.* ; Virshup, I. ; Walczysko, P.* ; Watson, A.M.* ; Weisbart, E.* ; Wong, F.* ; Yamauchi, K.A.* ; Bayraktar, O.* ; Cimini, B.A.* ; Gehlenborg, N.* ; Haniffa, M.* ; Hotaling, N.* ; Onami, S.* ; Royer, L.A.* ; Saalfeld, S.* ; Stegle, O.* ; Theis, F.J. ; Swedlow, J.R.*

OME-Zarr: A cloud-optimized bioimaging file format with international community support.

Histochem. Cell Biol. 160, 223-251 (2023)
Verlagsversion DOI PMC
Open Access Hybrid
Creative Commons Lizenzvertrag
A growing community is constructing a next-generation file format (NGFF) for bioimaging to overcome problems of scalability and heterogeneity. Organized by the Open Microscopy Environment (OME), individuals and institutes across diverse modalities facing these problems have designed a format specification process (OME-NGFF) to address these needs. This paper brings together a wide range of those community members to describe the cloud-optimized format itself-OME-Zarr-along with tools and data resources available today to increase FAIR access and remove barriers in the scientific process. The current momentum offers an opportunity to unify a key component of the bioimaging domain-the file format that underlies so many personal, institutional, and global data management and analysis tasks.
Impact Factor
Scopus SNIP
Web of Science
Times Cited
Scopus
Cited By
Altmetric
2.300
0.000
3
1
Tags
Anmerkungen
Besondere Publikation
Auf Hompepage verbergern

Zusatzinfos bearbeiten
Eigene Tags bearbeiten
Privat
Eigene Anmerkung bearbeiten
Privat
Auf Publikationslisten für
Homepage nicht anzeigen
Als besondere Publikation
markieren
Publikationstyp Artikel: Journalartikel
Dokumenttyp Wissenschaftlicher Artikel
Schlagwörter Bioimaging ; Cloud ; Community ; Data ; Fair ; Format; Image Data; Platform
Sprache englisch
Veröffentlichungsjahr 2023
HGF-Berichtsjahr 2023
ISSN (print) / ISBN 0948-6143
e-ISSN 1432-119X
Zeitschrift Histochemistry and Cell Biology
Quellenangaben Band: 160, Heft: 3, Seiten: 223-251 Artikelnummer: , Supplement: ,
Verlag Springer
Verlagsort One New York Plaza, Suite 4600, New York, Ny, United States
Begutachtungsstatus Peer reviewed
Institut(e) Institute of Computational Biology (ICB)
POF Topic(s) 30205 - Bioengineering and Digital Health
Forschungsfeld(er) Enabling and Novel Technologies
PSP-Element(e) G-503800-001
Förderungen Wellcome Trust
DOI 10.1007/s00418-023-02209-1
WOS ID 001039590300001
Scopus ID 85164336665
PubMed ID 37428210
Erfassungsdatum 2023-10-06
[➜Korrektur melden]