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Parameter estimation and uncertainty quantification for image based systems biology.
Parameterschätzung und Unsicherheitsanalyse für die bildbasierte Systembiologie.
München, Technische Universität, Fakultät für Mathematik, Diss., 2016, 130 S.
Parameter estimation problems in image based systems biology face problems such as partial observations, high noise levels and parameter indeterminacy combined with the computational complexity of PDE models. This work develops a novel fast method for uncertainty quantification for PDE constrained inverse problems with a special focus on the requirements of systems biology. The merits of the method are evaluated on two biological applications, which yielded new biological insights.
In der bildbasierten System Biologie stellen teilweise Beobachtungen, hohe Messfehler und Parameterunbestimmheiten sowie der Rechenaufwand der betrachteten PDG Modelle eine große Herausforderung für die Parameterschätzung dar. In dieser Arbeit wurde eine neue, schnelle Methode zur Bestimmung von Parameterunsicherheiten in Inverse Probleme mit PDG Nebenbedingungen entwickelt, dabei lag ein spezieller Fokus auf den Anforderungen der System Biologie. Die Vorzüge der Methode wurden an zwei biologischen Anwendungen aufgezeigt.
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Publication type
Other: Thesis
Thesis type
Doctoral thesis
Quellenangaben
Pages: 130 S.
University
Technische Universität
University place
München
Faculty
Fakultät für Mathematik
Institute(s)
Institute of Computational Biology (ICB)