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OME-Zarr: A cloud-optimized bioimaging file format with international community support.

Histochem. Cell Biol. 160, 223-251 (2023)
DOI PMC
Creative Commons Lizenzvertrag
Open Access Green möglich sobald Postprint bei der ZB eingereicht worden ist.
A growing community is constructing a next-generation file format (NGFF) for bioimaging to overcome problems of scalability and heterogeneity. Organized by the Open Microscopy Environment (OME), individuals and institutes across diverse modalities facing these problems have designed a format specification process (OME-NGFF) to address these needs. This paper brings together a wide range of those community members to describe the cloud-optimized format itself-OME-Zarr-along with tools and data resources available today to increase FAIR access and remove barriers in the scientific process. The current momentum offers an opportunity to unify a key component of the bioimaging domain-the file format that underlies so many personal, institutional, and global data management and analysis tasks.
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Publikationstyp Artikel: Journalartikel
Dokumenttyp Wissenschaftlicher Artikel
Korrespondenzautor
Schlagwörter Bioimaging ; Cloud ; Community ; Data ; Fair ; Format; Image Data; Platform
ISSN (print) / ISBN 0948-6143
e-ISSN 1432-119X
Zeitschrift Histochemistry and Cell Biology
Quellenangaben Band: 160, Heft: 3, Seiten: 223-251 Artikelnummer: , Supplement: ,
Verlag Springer
Verlagsort One New York Plaza, Suite 4600, New York, Ny, United States
Nichtpatentliteratur Publikationen
Begutachtungsstatus Peer reviewed
Institut(e) Institute of Computational Biology (ICB)
Förderungen Wellcome Trust