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Effective--a database of predicted secreted bacterial proteins.
Nucleic Acids Res. 39, D591-D595 (2011)
Protein secretion is a key virulence mechanism of pathogenic and symbiotic bacteria, which makes the investigation of secreted proteins ('effectors') crucial for understanding the molecular bacterium-host interactions. Effective (http://effectors.org) is a database of predicted bacterial secreted proteins, implementing two complementary prediction strategies for protein secretion: the identification of eukaryotic-like protein domains and the recognition of signal peptides in amino acid sequences. The Effective web portal provides user-friendly tools for browsing and retrieving comprehensive precalculated predictions for whole bacterial genomes as well as for the interactive prediction of effectors in user-provided protein sequences.
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Anmerkungen
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Publikationstyp
Artikel: Journalartikel
Dokumenttyp
Wissenschaftlicher Artikel
Sprache
englisch
Veröffentlichungsjahr
2011
HGF-Berichtsjahr
0
ISSN (print) / ISBN
0305-1048
e-ISSN
1362-4962
Zeitschrift
Nucleic Acids Research
Quellenangaben
Band: 39,
Heft: Database issue,
Seiten: D591-D595
Verlag
Oxford University Press
Begutachtungsstatus
Peer reviewed
PubMed ID
21071416
Erfassungsdatum
2011-12-31