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Wong, P.* ; Kolesov, G. ; Frishman, D. ; Houry, W.A.*

Phylogenetic Web Profiler.

Bioinformatics 19, 782-783 (2003)
Verlagsversion DOI
Open Access Gold
Summary: Phylogenetic Web Profiler (PWP) is a web-based service designed to perform phylogenetic profiling of proteins against genomes. The current version offers a selection of 63 completed genomes and available plasmids as annotated in the PEDANT genome database. Unlike currently available applications, this tool offers several choices of ortholog prediction parameters including E-value cutoff, percent length difference tolerance, and annotation similarity. Additional features include tight integration with the PEDANT database and tools to analyze properties of predicted proteins. PWP should prove very useful for the analysis of functional-linkage between proteins.
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Publikationstyp Artikel: Journalartikel
Dokumenttyp Wissenschaftlicher Artikel
Sprache englisch
Veröffentlichungsjahr 2003
HGF-Berichtsjahr 0
e-ISSN 1367-4811
Zeitschrift Bioinformatics
Quellenangaben Band: 19, Heft: 6, Seiten: 782-783 Artikelnummer: , Supplement: ,
Verlag Oxford University Press
Verlagsort Oxford
Begutachtungsstatus Peer reviewed
Institut(e) Institute of Bioinformatics and Systems Biology (IBIS)
DOI 10.1093/bioinformatics/btg064
Erfassungsdatum 2003-10-10
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