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Bleves, S.* ; Dunger, I. ; Walter, M.C. ; Frangoulidis, D.* ; Kastenmüller, G. ; Voulhoux, R.* ; Ruepp, A.

HoPaCI-DB: Host-Pseudomonas and Coxiella interaction database.

Nucleic Acids Res. 42, D671-D676 (2014)
Verlagsversion Volltext DOI PMC
Open Access Gold
Creative Commons Lizenzvertrag
Bacterial infectious diseases are the result of multifactorial processes affected by the interplay between virulence factors and host targets. The host-Pseudomonas and Coxiella interaction database (HoPaCI-DB) is a publicly available manually curated integrative database (http://mips.helmholtz-muenchen.de/HoPaCI/) of host-pathogen interaction data from Pseudomonas aeruginosa and Coxiella burnetii. The resource provides structured information on 3585 experimentally validated interactions between molecules, bioprocesses and cellular structures extracted from the scientific literature. Systematic annotation and interactive graphical representation of disease networks make HoPaCI-DB a versatile knowledge base for biologists and network biology approaches.
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Publikationstyp Artikel: Journalartikel
Dokumenttyp Wissenschaftlicher Artikel
Schlagwörter Interaction Networks; Representation; Information; Resources; Diseases; Biology; Models; Kegg
Sprache englisch
Veröffentlichungsjahr 2014
Prepublished im Jahr 2013
HGF-Berichtsjahr 2013
ISSN (print) / ISBN 0305-1048
e-ISSN 1362-4962
Zeitschrift Nucleic Acids Research
Quellenangaben Band: 42, Heft: D1, Seiten: D671-D676 Artikelnummer: , Supplement: ,
Verlag Oxford University Press
Verlagsort Oxford
Begutachtungsstatus Peer reviewed
Institut(e) Institute of Bioinformatics and Systems Biology (IBIS)
POF Topic(s) 30505 - New Technologies for Biomedical Discoveries
Forschungsfeld(er) Enabling and Novel Technologies
PSP-Element(e) G-503700-001
PubMed ID 24137008
DOI 10.1093/nar/gkt925
WOS ID WOS:000331139800099
Scopus ID 84891807504
Erfassungsdatum 2013-11-06
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