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Lange, O.F.

Automatic NOESY assignment in CS-RASREC-Rosetta.

J. Biomol. NMR 59, 147-159 (2014)
DOI PMC
Open Access Green möglich sobald Postprint bei der ZB eingereicht worden ist.
We have developed an approach for simultaneous structure calculation and automatic Nuclear Overhauser Effect (NOE) assignment to solve nuclear magnetic resonance (NMR) structures from unassigned NOESY data. The approach, autoNOE-Rosetta, integrates Resolution Adapted Structural RECombination (RASREC) Rosetta NMR calculations with algorithms for automatic NOE assignment. The method was applied to two proteins in the 15-20 kDa size range for which both, NMR and X-ray data, is available. The autoNOE-Rosetta calculations converge for both proteins and yield accurate structures with an RMSD of 1.9 Å to the X-ray reference structures. The method greatly expands the radius of convergence for automatic NOE assignment, and should be broadly useful for NMR structure determination.
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Publikationstyp Artikel: Journalartikel
Dokumenttyp Wissenschaftlicher Artikel
Schlagwörter Automatic Noe Assignment ; Nuclear Magnetic Resonance ; Structure Determination; Nmr Structure Determination; Chemical-shift Data; Structure Prediction; Protein; Suite
Sprache englisch
Veröffentlichungsjahr 2014
HGF-Berichtsjahr 2014
ISSN (print) / ISBN 0925-2738
e-ISSN 1573-5001
Zeitschrift Journal of Biomolecular NMR
Quellenangaben Band: 59, Heft: 3, Seiten: 147-159 Artikelnummer: , Supplement: ,
Verlag Springer
Verlagsort Dordrecht
Begutachtungsstatus Peer reviewed
Institut(e) Institute of Structural Biology (STB)
POF Topic(s) 30203 - Molecular Targets and Therapies
Forschungsfeld(er) Enabling and Novel Technologies
PSP-Element(e) G-503000-001
PubMed ID 24831340
DOI 10.1007/s10858-014-9833-3
WOS ID WOS:000338316800002
Scopus ID 84904071275
Scopus ID 84901523495
Erfassungsdatum 2014-06-04
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