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Stapor, P. ; Weindl, D. ; Ballnus, B. ; Hug, S. ; Loos, C. ; Fiedler, A. ; Krause, S. ; Hross, S. ; Fröhlich, F. ; Hasenauer, J.

PESTO: Parameter EStimation TOolbox.

Bioinformatics 34, 705-707 (2018)
Verlagsversion Forschungsdaten DOI PMC
Open Access Hybrid
Creative Commons Lizenzvertrag
Summary PESTO is a widely applicable and highly customizable toolbox for parameter estimation in MathWorks M ATLAB. It offers scalable algorithms for optimization, uncertainty and identifiability analysis, which work in a very generic manner, treating the objective function as a black box. Hence, PESTO can be used for any parameter estimation problem, for which the user can provide a deterministic objective function in MATLAB. Availability and implementation PESTO is a MATLAB toolbox, freely available under the BSD license. The source code, along with extensive documentation and example code, can be downloaded from https://github.com/ICB-DCM/PESTO/. Contact jan.hasenauer@helmholtz-muenchen.de Supplementary informationSupplementary dataare available at Bioinformatics online.
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Publikationstyp Artikel: Journalartikel
Dokumenttyp Wissenschaftlicher Artikel
Sprache englisch
Veröffentlichungsjahr 2018
Prepublished im Jahr 2017
HGF-Berichtsjahr 2017
e-ISSN 1367-4811
Zeitschrift Bioinformatics
Quellenangaben Band: 34, Heft: 4, Seiten: 705-707 Artikelnummer: , Supplement: ,
Verlag Oxford University Press
Verlagsort Oxford
Begutachtungsstatus Peer reviewed
Institut(e) Institute of Computational Biology (ICB)
POF Topic(s) 30205 - Bioengineering and Digital Health
Forschungsfeld(er) Enabling and Novel Technologies
PSP-Element(e) G-553800-001
DOI 10.1093/bioinformatics/btx676
WOS ID WOS:000424889300029
Scopus ID 85042541620
PubMed ID 29069312
Erfassungsdatum 2017-11-13
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