PuSH - Publikationsserver des Helmholtz Zentrums München

Export: TXT Text RIS Endnote (RIS) BIB BibTeX
Chetnik, K.* ; Benedetti, E.* ; Gomari, D.P. ; Schweickart, A.* ; Batra, R.* ; Buyukozkan, M.* ; Wang, Z.* ; Arnold, M. ; Zierer, J.* ; Suhre, K.* ; Krumsiek, J.*

maplet: An extensible R toolbox for modular and reproducible metabolomics pipelines.

Bioinformatics 38, 1168-1170 (2022)
Verlagsversion DOI PMC
Open Access Hybrid
Creative Commons Lizenzvertrag
This paper presents maplet, an open-source R package for the creation of highly customizable, fully reproducible statistical pipelines for metabolomics data analysis. It builds on the SummarizedExperiment data structure to create a centralized pipeline framework for storing data, analysis steps, results, and visualizations. maplet's key design feature is its modularity, which offers several advantages, such as ensuring code quality through the maintenance of individual functions and promoting collaborative development by removing technical barriers to code contribution. With over 90 functions, the package includes a wide range of functionalities, covering many widely used statistical approaches and data visualization techniques. AVAILABILITY: The maplet package is implemented in R and freely available at https://github.com/krumsieklab/maplet.
Impact Factor
Scopus SNIP
Scopus
Cited By
Altmetric
6.931
2.056
3
Tags
Anmerkungen
Besondere Publikation
Auf Hompepage verbergern

Zusatzinfos bearbeiten
Eigene Tags bearbeiten
Privat
Eigene Anmerkung bearbeiten
Privat
Auf Publikationslisten für
Homepage nicht anzeigen
Als besondere Publikation
markieren
Publikationstyp Artikel: Journalartikel
Dokumenttyp Wissenschaftlicher Artikel
Sprache englisch
Veröffentlichungsjahr 2022
Prepublished im Jahr 2021
HGF-Berichtsjahr 2021
e-ISSN 1367-4811
Zeitschrift Bioinformatics
Quellenangaben Band: 38, Heft: 4, Seiten: 1168-1170 Artikelnummer: , Supplement: ,
Verlag Oxford University Press
Verlagsort Oxford
Begutachtungsstatus Peer reviewed
Institut(e) Institute of Computational Biology (ICB)
POF Topic(s) 30205 - Bioengineering and Digital Health
Forschungsfeld(er) Enabling and Novel Technologies
PSP-Element(e) G-503891-001
Förderungen National Institute on Aging
National Institute of Aging of the National Institutes of Health
Qatar National Research Fund (QNRF)
'Biomedical Research Program' funds at Weill Cornell Medical College in Qatar, a program - Qatar Foundation
DOI 10.1093/bioinformatics/btab741
WOS ID WOS:000747962400047
PubMed ID 34694386
Erfassungsdatum 2021-12-16
[➜Korrektur melden]