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Cayir, A.* ; Tannæs, T.M.* ; Saeed, S.* ; Blüher, M. ; Böttcher, Y.*

Protocol for chromatin immunoprecipitation of histone modifications in frozen adipose tissue.

STAR Protoc. 5:103163 (2024)

Verlagsversion

DOI

PMC

	Open Access Gold

Abstract
Metriken
Zusatzinfos

Chromatin immunoprecipitation (ChIP) combined with sequencing has revolutionized our understanding of gene regulation; however, its application to frozen adipose tissue presents unique challenges due to the high levels of lipid content. Here, we present a protocol for ChIP of histone modifications in human frozen adipose tissue. We describe steps for tissue preparation, chromatin isolation, sonication, pre-clearing of chromatin, and immunoprecipitation. We then detail procedures for elution, crosslink reversal, chromatin purification, quality control, and library synthesis.

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