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Genome-wide association analyses identify 143 risk variants and putative regulatory mechanisms for type 2 diabetes.

Nat. Commun. 9:2941 (2018)
Verlagsversion Forschungsdaten DOI PMC
Open Access Gold
Creative Commons Lizenzvertrag
Type 2 diabetes (T2D) is a very common disease in humans. Here we conduct a meta-analysis of genome-wide association studies (GWAS) with ~16 million genetic variants in 62,892 T2D cases and 596,424 controls of European ancestry. We identify 139 common and 4 rare variants associated with T2D, 42 of which (39 common and 3 rare variants) are independent of the known variants. Integration of the gene expression data from blood (n = 14,115 and 2765) with the GWAS results identifies 33 putative functional genes for T2D, 3 of which were targeted by approved drugs. A further integration of DNA methylation (n = 1980) and epigenomic annotation data highlight 3 genes (CAMK1D, TP53INP1, and ATP5G1) with plausible regulatory mechanisms, whereby a genetic variant exerts an effect on T2D through epigenetic regulation of gene expression. Our study uncovers additional loci, proposes putative genetic regulatory mechanisms for T2D, and provides evidence of purifying selection for T2D-associated variants.
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Publikationstyp Artikel: Journalartikel
Dokumenttyp Wissenschaftlicher Artikel
Sprache englisch
Veröffentlichungsjahr 2018
HGF-Berichtsjahr 2018
ISSN (print) / ISBN 2041-1723
e-ISSN 2041-1723
Zeitschrift Nature Communications
Quellenangaben Band: 9, Heft: 1, Seiten: , Artikelnummer: 2941 Supplement: ,
Verlag Nature Publishing Group
Verlagsort London
Begutachtungsstatus Peer reviewed
Institut(e) Institute of Genetic Epidemiology (IGE)
Institute of Human Genetics (IHG)
POF Topic(s) 30501 - Systemic Analysis of Genetic and Environmental Factors that Impact Health
Forschungsfeld(er) Genetics and Epidemiology
PSP-Element(e) G-504100-001
G-500700-001
DOI 10.1038/s41467-018-04951-w
Scopus ID 85050718439
PubMed ID 30054458
Erfassungsdatum 2018-09-06
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