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Genetic code expansion method for temporal labeling of endogenously expressed proteins.
ACS Chem. Biol. 13, 3049-3053 (2018)
We here present a method that combines genetic code expansion with CRISPR/Cas9 genome engineering to label endogenously expressed proteins with high spatiotemporal resolution. The method exploits the use of an orthogonal tRNA/tRNA synthetase pair in conjugation with noncanonical amino acids to create stop codon read through events. To demonstrate the functionality of the method, we pulse labeled endogenous β-actin and tumor protein p53 with a minimally invasive HA tag at their C-termini. Targeting the protein label with a proximity ligation assay plus real time imaging facilitates seamless quantification of the protein synthesis rate and spatial localization at the single cell level. The presented approach does not interfere with any physiological control of cellular expression, nor did we observe any perturbation of endogenous protein functions.
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4
Anmerkungen
Besondere Publikation
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Publikationstyp
Artikel: Journalartikel
Dokumenttyp
Wissenschaftlicher Artikel
Sprache
englisch
Veröffentlichungsjahr
2018
HGF-Berichtsjahr
2018
ISSN (print) / ISBN
1554-8929
e-ISSN
1554-8937
Zeitschrift
ACS Chemical Biology
Quellenangaben
Band: 13,
Heft: 11,
Seiten: 3049-3053
Verlag
American Chemical Society (ACS)
Verlagsort
Washington
Begutachtungsstatus
Peer reviewed
Institut(e)
Helmholtz Pioneer Campus (HPC)
POF Topic(s)
30201 - Metabolic Health
Forschungsfeld(er)
Pioneer Campus
PSP-Element(e)
G-510002-001
Scopus ID
85055152468
PubMed ID
30335949
Erfassungsdatum
2018-10-24